如果有以下情况，当事人是不能通过婚姻登记处办理协议离婚手续的：
(1)一方要求离婚，而另一方不同意离婚的，要求离婚的一方就只有向法院起诉要求离婚。
(2)一方当事人为精神病患者，被医院确诊为无民事行为能力的，只能由另一方向法院起诉要求离婚。
(3)双方要求离婚，但是对子女抚养、财产及债务处理等事项不能达成协议的，当事人只能通过法院解决双方的争议，解除婚姻关系。
(4)当事人根本没有办理结婚登记，婚姻登记处是不受理离婚申请的`。1994年2月1日以前就存在的事实婚姻，只能到法院办理离婚手续，1994年2月1日以后，男女双方在一起生活的同居关系，可以自行解除，不需要到婚姻登记处或法院办理解除手续，只是双方有财产或子女抚养纠纷的，才可以向法院起诉解决。
(5)双方是在外国或港、澳、台地区登记结婚的，不论双方能否达成协议，只能通过法院诉讼的方式离婚。